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  • Invitrogen RT-PCR 新工具

    文/ 发布于2017-11-20 浏览次数:1213

      反转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction RT-PCR)是一项有效的和广泛使用的研究工具,它可以用于多种应用,包括RNA检测、基因定量以及克隆。随着这项技术的逐渐普及,针对提高速度、方便性和多用途性的革新方案的需求,也变得越来越迫切。作为反转录的领先者,Invitrogen 不断地推出满足这些需求的、新颖的、高性能的解决方案,以提供快速的cDNA合成,方便的冻干试剂RT,直接从细胞进行高产量的cDNA合成,高保真的克隆的RT-PCR以及对困难RNA模板进行更加成功的RT-PCR。

      Invitrogen 性能卓越的系统整合了可以利用的最好的RT技术,包括SuperScript III RT和最新推出的Thermo-XRT。SuperScript III RT是M-MLV RT基因工程升级版本,减少了RNaseH活性,提供更高的热稳定性(1-3)。这种酶可以在高达55℃的情况下合成cDNA,比以前使用的反转录酶提供更高的特异性,更高的cDNA产量以及更多的全长产物。Thermo-X? RT克隆自一种嗜热真细菌,提供高达70℃的热稳定性,因而即使是最具挑战性的模板也可以进行有效的RT-PCR.。

      通过SuperMix形式快速合成cDNA

      SuperScriptIII First—Strand Synthesis SuperMix将所有进行强大的、灵敏的第一链cDNA合成所必须的组分组合成快速、易于使用的 SuperMix形式。SuperMix形式包含 2x RT缓冲反应混合物、dNTPs、MgCl2、 以及由SuperScript III RT和RNaseOUT组成的酶混合物。也提供优化的退火缓冲液以提高反应灵敏度和产量。性能卓越的混合物能够从低至0.1pg的总RNA中检测到看家基因(图1)和从长达12kb的靶标中高产量地合成cDNA,以进行多种RT-PCR应用,包括基因检测和全长基因克隆。

      III First--Strand Synthesis SuperMix提供卓越的灵敏度

      使用SuperScript III First--Strand Synthesis SuperMix,0.1pg到100pg的总HeLa RNA,和看家基因引物对在50℃进行cDNA反应。使用Platinum PCR SuperMix.以1min/kb进行PCR反应。使用SuperScriptIII First-Strand Synthesis System进行RT-PCR合成cDNA作为对照反应。

      方便的室温稳定(Room Temperature Stable RTS)试剂

      SuperScript III RTS(室温稳定Room Temperature Stable)试剂整合了您需要的一切,以方便的、一次使用的冻干分装形式提供高产量第一链cDNA合成。使用专利的冻干程序,在有冷冻保护剂存在的情况下,预混合、分装和冻干每个系统的组分。提供在室温下长达一年的稳定,同时确保酶活性的最大恢复。再次悬浮快速而简单:简单地加入引物和模板,再次悬浮反应混合物,短时vortex振荡混匀,就可以进行合成了。

      SuperScript III RTS第一链cDNA合成系统

      这个系统包含进行第一链cDNA合成所需要的所有组分。可以用来从低至0.1pg的总RNA中检测看家基因(housekeeping genes),以及通过RT-PCR从长达12kb的靶标中合成高产量的cDNA。

      在室温度下运输、贮存和组合反应混合物,使得这个RTS试剂盒成为进行多种RT-PCR应用的理想选择。

      III RTS First-Strand Synthesis System以方便的形式提供高灵敏度

      使用SuperScriptIII RTS First-Strand Synthesis System,0.1pg到100pg的总HeLa RNA和和看家基因引物对在50℃进行cDNA合成反应。使用Platinum PCR SuperMix.以1min/kb进行PCR反应。使用SuperScriptIII First-Strand Synthesis System进行RT-PCR合成cDNA作为对照反应。

      用于克隆的高保真一步RT-PCR

      想要获得较高的RT-PCR产量和保真度以进行克隆,以及进行长模板的检测,使用包含Platinum Taq High Fidelity的 SuperScript III One-Step RT-PCR System是您最佳的选择。SuperScript III 的cDNA高产量结合自动热启动技术以及Platinum Taq High Fidelity的3 ′到 5 ′校正外切酶活性,提供了一种强大、灵敏而特异的一步RT-PCR系统。

      优化的反应条件为各种应用提供更高的产量和保真度,包括一步克隆、多重RT-PCR和检测长达9kb的RNA靶标。使用包含Platinum Taq High Fidelity的 SuperScript III One-Step RT-PCR System时,能够在温度高达60℃的条件下合成cDNA,使得这个试剂盒成为在克隆要求升高RT温度以获得最佳产量和特异性的基因时理想的选择。

      直接通过细胞进行高产量的cDNA合成

      SuperScript III CellsDirect cDNA Synthesis Kit提供直接通过哺乳动物细胞进行高产量第一链cDNA的合成,没有单独的RNA分离步骤,使得RNA分离步骤样品的损失减少到最小,以保证对所有转录本的代表性。用于小样本效果理想,能够在不到2个小时的时间内通过10,000个细胞直到一个细胞(相当于∽10pg的总RNA)合成cDNA。

      细胞在含有RNaseOUT的低渗液中加热重新悬浮,产生的cDNA直接以可重复的、剂量依赖的方式反映了细胞转录本的水平。这个系统与所有哺乳动物组织培养细胞系兼容,包括HeLa,COS-7,293,Jurkat,CV1,和K562。此外,很多基因使用通过单一细胞合成的cDNA,包括GAPDH和低丰度看家基因HMBS。合成cDNA能够用在很多下游应用中,如PCR、克隆、基因检测、和定量。

      panel A 使用GAPDH(1181)引物扩增HeLa细胞cDNA.

      panel B 使用HMBS(329)引物扩增K562细胞cDNA.

      使用SuperScript III CellsDirect? cDNA Synthesis Kit从系列稀释的细胞中(10,000到1个细胞)直接合成cDNA。取2μl每个合成cDNA产物,在50μl反应体系中进行PCR反应。取20%的PCR反应物在1%琼脂糖凝胶上电泳分析。

      针对困难RNA模板的Thermo-X RT

      Thermo-X RT是目前可以利用的热稳定性最高的反转录酶,设计用来针对最困难RNA模板合成cDNA。Thermo-X RT克隆自一种嗜热真细菌(thermophilic eubacteria),比起当前来源于嗜温有机体(mesophilic organisms)的RT,如MMLV 或者 AMV具有更高的热稳定性。较高的RT反应温度通过帮助熔解GC含量高的RNA部分或者二级结构,能够潜在地减轻cDNA合成期间出现的终止(4-6),因而为困难RNA靶标提供更高的特异性,更高的cDNA产量和更多的全长cDNA产物。

      Thermo-X RT在65℃的半衰期是120分钟,能够合成全长达9.5kb的cDNA。此外,Thermo-X RT不象其它竞争的热稳定RT要求Mn2+(一种下游PCR反应的抑制剂),它在存在Mg2+时就可以保持最佳的RT活性。在60℃到70℃可以获得出色的结果。Thermo-X RT在灵敏度、特异性、cDNA产量和靶标长度都超越了竞争对手。

      使用15 U ThermoScript或者 200 U Thermo-XRT,在存在poly(A)-tailed RNA ladder,oligo (dT)20和γ32P dCTP时,在50℃到70℃下进行RT反应。反应产物在1.2%的碱性琼脂糖凝胶中分离,通过放射自显影观察。

      Thermo-X反转录酶超越了其它竞争者

      使用10ng到100ngHeLa细胞总RNA和基因特异引物RT反应,按照生产商的说明书,在60℃或者70℃进行RT反应。使用Platinum PCR SuperMix High Fidelity和所示的引物对,以1kb/min进行35个循环的PCR反应。

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