该叶绿素仪测量值的校准通过下面程序完成。

（1）在校准过程中，测量头不夹样品，二个LED次序发光，被接收的光转换成电信号，光强度的比率被用来计算。
（2）在测量头夹住样品后，二个LED再次发光，通过叶片传输的光打到接收器上，被转换成电信号，传输光的强度比率被计算。
（3）步骤1和2的值用于计算SPAD测量值，即表示夹住的样品叶片当前叶绿素相对含量。