冻存管一般密封性很好，但是再好的管子在液氮的绝对零度情况下都会收缩，势必导致液氮进入管内。但是要想到，你的细胞一般都是在冻存盒或者-80冰箱已经冷冻后的，所以污染的机会不大。
同时细菌会因为没有加入甘油而被形成的冰晶破坏，不会造成太大的影响。至于支原体和衣原体不是外源的带入通常不会有问题。因此基本上可以用的。同时还有一个办法是：尽量用1ml的冻存管，或者用2ml的管子尽量加到标明的刻度体积。剩下的很少液氮就会很快在在拿出后挥发。
还有就是我们通常拿出后都会轻轻地旋松管盖，使液氮迅速蒸发，然后再旋紧盖子快速水浴，5年来没有发现因为冻存引起的污染。通常是你冻存前细胞就已经被污染了，
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