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  • 抗体选择(抗体,蛋白,叠氮化钠,特异性,二抗)

    文/ 发布于2017-11-20 浏览次数:1049

      随着生命科学的发展,围绕蛋白进行的研究越来越多,抗体试剂在实验中的重要性越来越举足轻重。面临着纷呈复杂的抗体试剂市场,如何选择到适合自己实验的抗体就变得尤为重要。

      当我们要检测目的蛋白在组织中表达情况的时候,如何选择适合我们实验需要的抗体,并恰当保存使用,是每个科研人员需要细心考虑的。抗体种类繁多,品牌众 多,技术参数不一,价格和质量更是相差甚大,如何购买到高质量价格合适的抗体,并准确地做出我们想要的结果,其中有很多细节需要注意。

      一、抗体选择总体原则

      1. 关于特异性的选择

      特异性的选择主要需要考虑四个方面:蛋白特异性、种属特异性、实验方法特异性、标记物的特异性。

      (1)蛋白特异性

      针对需要检测的蛋白查找抗体,几个细节要区分,重组表达的蛋白和内源性蛋白的检测,对抗体的要求是不一样的,注意查看抗体说明书的检测说明。如果重组蛋白不是全长表达,则需要注意抗体的免疫原区域是否在重组蛋白区域内。内源性蛋白最好能清楚其剪切与修饰的方式,特殊表型的蛋白需要进行序列比对,并结合抗体免疫原序列,查看交叉反应的情况。磷酸化蛋白检测需要确定具体位点,不同位点的磷酸化意味着可能有不同的机制存在,不宜一概而论。

      (2)种属特异性

      同种蛋白不同物种,有着或大或小的差异。目前大部分商品化抗体都是以人源蛋白序列为模板重组蛋白或设计多肽抗原的,根据蛋白的同源性情况与其他种属发生交叉反应。需要参照说明书注明的可反应种属信息。一些稀有种属很难找到抗体,可以通过蛋白的序列比对,选择同源序列免疫的抗体,不过一般这种情况生产商不会受理其关于质量的申诉,如果可以申请到免费的抗体样品,则利于抗体选择。

      (3)实验方法特异性

      目前使用抗体的实验方法有很多,不同的使用方法过程中,因为对蛋白样品的处理方式不一样,蛋白的含量有差异,对抗体的识别表位和效价要求都是不一样的。具体的根据说明书注明的产品应用方法进行选择。但是生产商一般不会将每个抗体都进行各种实验的检测,目前检测比较多的只是WB、IHC、IF等,如果针对具体的实验方法没有找到合适的抗体的,可以结合蛋白序列分析和抗体的抗原信息,选择尽可能有效果的抗体。同样,申请到免费的抗体样品是个很好的途径。

      (4)标记物的特异性

      一般基于实验操作的实验方法不会使用带有标记的一抗,比如WB、IHC等,都是通过二抗类的试剂标记达到结果呈现的目的。但是基于仪器分析的一些实验,可能就会使用到直接标记的一抗,比如流式实验。那么需要了解到自己将要使用的仪器能检测到的荧光范围,针对不通的参数要求选择对应的标记物。在免疫荧光双标实验中,需要选配不同的荧光标记物。

      2. 抗体种属来源的选择

      有人认为单抗比多抗好,其实这并不是一个严谨的观点,只能说在可能性上单抗的特异性更好一些,而多抗的亲和力会优于单抗,并且特异性并不一定就逊于单抗,主要看抗原的设计水平。目前商品化抗体里单抗主要是鼠单抗、兔单抗,多抗主要是兔多抗、山羊多抗等,其他种属来源抗体较少。不建议纠结于单抗好还是多抗好,能做出实验的抗体就是好抗体。

      在选择上一般建议实验种属和抗体种属亲缘性越远越好,不宜同源。抗体不同种属会要影响接下来二抗的选配。特别是在免疫荧光双标实验中,需要在区别于实验种属的基础上,区分开两个指标的抗体种属来源,以便于二抗区别识别。

      3. 关于性价比的选择

      抗体的品质高低最终还是需要通过实验结果来呈现的,但是在选择抗体之前我们并无法准确判断抗体的效果如何。无论什么品牌的,无论进口还是国产的,都会有用得不错的产品,也都会有做不出来的产品。抗体属于异质化产品,不同品牌之间,甚至同一品牌的不同产品之间,抗体品质差异都较为明显,而且没有统一的衡量标准。这是抗体选择中最难的一个问题。很多人习惯于根据实验室传统意识或参考文献上使用的产品进行选择,但是因为不同批次间的抗体效果也是有差异的,所以并不能完全确保正确选择。在这种情况下,抗体的售后就尤为重要,遇到抗体品质障碍时,能够确保有效地解决问题,不至于影响实验的进展。现在有部分品牌可以提供免费的抗体小样的,无疑对这个问题是一个很好的解决方案。先确定抗体是否适合自己的实验,可以避免因为抗体质量投诉耽误实验安排。

      在价格方面,需要谨记,最贵的不一定就是最好的,最适合你的实验的才是最好的。花很多钱买到很贵的抗体,再花上很长的时间去投诉的情况并不少见。只买对的,不买贵的。在选择价格的时候还要注意规格大小、抗体浓度、效价范围等,要综合考虑。在规格方面,根据最终可以稀释成的工作液的量的来衡量更为准确。很多老品牌提供的抗体产品基本都是以大包装为主,就单个课题的实验而言,过大的包装有时会造成很大的浪费。目前Proteintech、Bioworld、Cell Signal等品牌都相继推出小包装的抗体,这在一定程度上给选择者更大的选择自由度,可以根据使用产品的效价,计算出自己实际需要的抗体量,做到精确定量采购。

      4. 怎样确定抗体购买渠道和品牌?

      国外著名抗体品牌的质量一般没问题,但价格较贵,而且很多抗体品牌本身不生产抗体,所以能找到OEM抗体生产商生产的原装进口抗体,随着网络技术的越来越普及,我们自己就可以通 过国内外的相关网站来检索,国外最大的生物试剂查询网站:biocompare,国内最大的生物试剂查询网站:生物秀,来查找我们所需要的产品资料。

      因为抗体品质的异质化,关于抗体的品牌选择就被大家所重视,但是不管是什么品牌都难免会遇到不适合自己实验的抗体。所以一般建议考虑那些业内普遍认可、购买方便、技术支持专业、售后处理便捷的品牌。一些甚至都没有正式代理的,只能备选。同时购买时一定要找能够提供产品指导、实验分析、售后处理的正规代理商购买,避免因为买到假货水货影响实验。

      5. 关于其他一些小细节

      抗体选择与使用过程中,多少还会遇到一些意想不到的事情。有些细节,还是需要多注意一些。如在选择做阻断或中和实验时,有时需要将抗体加到细胞培养液中,这是需要注意抗体是否含有叠氮钠。如果是大包装的抗体,进行分装是比较节约的方式,如果是高效价的,可以配成母液再分装。抗体的短时间运输,用普通冰块保持温度是可以满足要求的。

      另外不要纠结于WB过程中分子量的问题。很多时候,我们看到同样的抗体,不同的品牌,甚至同一品牌不同的货号,标注的分子量都不一样。其实可能只是生产商只检测时使用了不同的种属不同的样品类型,或是参照了不同的文献,对使用者来说,同样的样品,不管使用哪个品牌的,只要抗体是对的,目的条带只会出现在相同的位置。关于分子量的问题,一般不建议看产品说明,WB中条带的位置由样品决定,并不会因为抗体不同而不同。所以在检测蛋白之前,我们可以通过数据库或参考文献,对将要检测的蛋白做个比较全面的了解,包括其可能剪切与修饰的情况、表型的情况等。在第一次使用一个新的抗体时,不要根据分子量横向剪膜,可以保留几个全泳道,看看条带位置或分布的情况。

      二、一抗、二抗的选择原理及方法

      1. 一抗选择要点

      (1)确定抗体的名字,注意中英文名字、它名、亚型等信息。

      (2)确定你的实验类型,Elisa,WB,IHC,ICC,还是FACS。一般抗体的说明书都会列出该抗体经验证过适用于何种实验的类型,如果抗体说明 书没有提及的应用类型,并不意味着该抗体不适用于此种分析应用类型,而仅是说明尚未经过此种实验验证,请根据说明书列出的已验证的类型来选择适合你实验的 抗体。

      (3)确定实验样本的种属,Human,Mouse,还是Rat。一般抗体说明书都列出该抗体经试验验证过适用于何种物种实验,请根据说明书列出已验证的种属来选择适合你实验的抗体。

      (4)样本蛋白的结构性质。了解样本蛋白的结构性质有助于选择最合适的抗体,待测样本蛋白的结构域和样本在提取和处理过程中是否会变性,蛋白空间构象的改变,会影响抗体的免疫亲和反应。

      (5)单多克隆抗体的选择。市面上的抗体还是以多克隆抗体为主,一般单克隆抗体特异性强,但亲和力相对小,检测抗原灵敏度相对就低;而多克隆抗体特异性稍弱,但抗体的亲和力强,灵敏度高,但易出现非特异性染色(可以通过封闭等避免)。

      2. 二抗选择要点

      (1)种属来源。主要根据一抗种属来源来决定购买二抗来源,如一抗是小鼠来源,那二抗就买抗小鼠的即可(羊、兔等均可)。

      (2)标记物的选择。有HRP、Biotin、荧光素等标记物。一般SP三步法二抗选择Biotin标记的二抗,以与后面的SP结合反应,而免疫荧光染色就需要购买不同荧光素标记的二抗,如罗丹明、FITC、Cy3等常用荧光素。

      3. 一抗具体选择分析

      检测任何目的靶蛋白都有不止一种抗体可供选择,在同一个抗体公司,可能会有好几种,甚至好几十种;在不同的抗体公司,那就更多了。那怎样在琳琅满目的抗体中,选择自己实验需要的抗体呢?主要考虑如下几种因素:分析自己实验应用的实验方法是哪种?分析自己实验中标本的种属是哪种动物或人的?分析样本中的蛋白质的结构性质,分析抗体的标记和检测,分析抗体的宿主来源种属等等。

      (1)分析自己实验应用的实验方法是哪种?

      一般抗体说明书都列出该抗体经试验验证过适用于何种分析类型,如:可以应用于WB、IHC、ICC、ELISA、FCM分析等。

      如果抗体说明书没有提及的应用类型,并不意味着该抗体不适用于此种分析应用类型,而仅是说明尚未经过此种分析试验验证。为了避免实验风险,当说明书中没有提及的应用方法时,可向商家申请测试装,进行测试后,再决定是否购买。

      如果抗体不适用某些分析试验,则会在抗体说明书上标注出来不适于某分析试验。

      (2)分析自己实验中标本的种属是哪种动物或人的?

      一般抗体说明书都列出该抗体经试验验证过适用于何种动物或人的标本,如:可以用于rat、mouse、human、pig、goat等动物的标本的实验。也就是说应选择物种相同或有交叉反应的抗体,抗体可能与不同物种的同种靶蛋白有交叉反应,因其氨基酸序列同源性较高。

      如果样本的种类未列入抗体说明书上的交叉反应种属表中,并不意味着该抗体不适用于检测该物种的蛋白,而只是表示该物种尚未用此抗体检测验证过。为了避免实验风险,尽量不要使用说明书中没有提及的标本的种属的抗体。

      或者通过序列比对的方法来预测交叉反应,可应用Expasy和NCBI BLAST来进行不同物种蛋白同源性比对。如果比对结果,证明同源性比较高的,也可以选择。

      (3)分析样本中的蛋白质的结构性质

      了解样本蛋白的结构性质有助于选择最合适的抗体,至少两方面因素需要考虑:

      待测样本蛋白的结构域:抗体是由各种不同免疫原免疫宿主而制备得来,其中的免疫原包括:全长蛋白、蛋白片断、多肽、全有机体(如:细菌)或细胞,抗体说明书一般都有免疫原的描述,如果打算检测的是蛋白片断或一种特殊的同型物或蛋白全长的某一区域,则必须选择用含此片段域的免疫原制备出的抗体。如果打算用FCM流式检测活细胞的表面蛋白,则需要选择含该表面蛋白的胞外域来免疫制备的抗体。

      样本的提取或处理过程:某些抗体要求样本经过某些特殊处理,例如:许多抗体只识别还原和变性的、表位已暴露不受二级四级结构阻碍的蛋白样本,另一方面,某些抗体仅识别天然折叠状态的蛋白。当选择免疫组化的抗体时,应注意某些抗体只识别未固定的冷冻的组织,而另一些抗体则适用于无需抗原修复解交联步聚的甲醛固定石蜡包埋的组织,这些都会在抗体说明书上应用部分标示出来。

      (4)抗体宿主物种的选择

      一般说来,在使用偶联二抗结合无偶联物的一抗时,一抗宿主动物的物种选择较为重要,对于免疫组化而言,尽可能选择与样本不同种系物种的一抗,从而避免二抗与样本内源性免疫球蛋白产生交叉反应,例如:检测小鼠样本蛋白,则不应选择小鼠或大鼠源的一抗,最好选兔源的一抗,则二抗则可选择偶联了检测分子(酶、荧光素、生物素等)的抗兔IgG。如果选择有偶联物的一抗则不适用上述情况,除免疫组化外的其它对不含内源性免疫球蛋白样本的检测方法,则抗体宿主物种的影响不大,如对不含IgG的细胞裂解物样本的western blotting检测,尽管如此,含有血清的组织裂解物和组织培养上清中含有免疫球蛋白,还原变性样本中含IgG,在western blot检测中则结合出现IgG分子50 and 25 kDa的重链和轻链条带。

      4. 内参选择

      三、抗体的保存

      1. 抗体的稳定性

      (1)抗体的稳定性是自然界长期进化的结果。抗体是免疫系统(immune system)中最重要的分子之一,其稳定性是自然进化筛选的结果。在众多物种中,抗体分子形成了保守而稳定的结构。

      (2)抗体分子的高Tm值。在室温下,甚至短时间温度达到50-60℃,抗体分子都能维持正确折叠,保持应有的活性。

      (3)抗体的纯度。采用先进的抗体纯化技术,确保抗体产品的高纯度,保障其抗体产品的稳定性。

      (4)抗体的浓度。高浓度的抗体产品可减少容器表面吸附造成的物质损失,高浓度的抗体稳定性更好,抗体产品中93%的浓度大于0.5 mg/ml。

      2. 抗体保存操作

      抗体无论是保存还是运输都应尽可能地避免反复冻融,收到抗体后请根据实验的需要,对抗体进行分装,避免同一管抗体反复冻融(反复冻融会导致抗体空间结构变 性,导致多聚体形成,从而降低抗体的结合能力)。抗体保存得当与否,直接决定了抗体的活性和使用效果,如果抗体保存得当,抗体活性大部分都可以维持数年。 请谨记,无论何时请按照说明书推荐的保存条件正确处理和保存抗体。

      (1)收到抗体后,请务必在4℃,12000rpm,离心3分钟,(无论是液体还是冻干粉状态),再打开管盖进行分装和保存(如果抗体体积小于50ul,请延长 离心时间至5分钟,以保证全部抗体均离心下来)。抗体一般使用特制的储存管,只有在12000rpm离心3分钟,才能将附着在管壁或盖内的抗体全部离心下 来(即使是在10000rpm离心也会离心不完全,导致出现抗体的量不足的现象)。

      (2)对于ProSci大部分抗体,比较合适的保存方式是,分装后保存在-20℃或者-80℃。

      1)对绝大多数抗体来说,保存在-20℃就完全足够了,没有任何证据显示保存在-80℃会更好。

      2)分装可以最大程度的降低反复冻融对抗体活性的损害,同时也降低了由于多次从同一管中吸取抗体造成的污染可能性。

      3)分装的量以一次实验用完为好,最少不能少于10ul每份。因为分装体积越小,抗体的浓度越可能会受到蒸发以及管壁吸附的影响。

      4)复融后的分装抗体如果一次用不完,将剩余母液保存在4℃,避免再冻起来。

      5)抗体工作液应该当天配制当天用完,4℃保存尽量不要超过1天。

      6)绝对避免将抗体保存在自动除霜冰箱中,将抗体保存在冰箱里层,避免温度变化造成反复冻融。

      (3)大部分抗体收到后4℃短暂保存1~2周对抗体活性没有影响。

      (4)大部分抗体的运输条件:一般的运输过程需要1~2周的时间,所以是在低温4℃的条件下来完成的。

      4℃运输最主要的目的是为了避免反复冻融对抗体活性的损害(如果使用干冰运输,那么收到时抗体是冻起来的,为了分装就需要解冻,这就多了一次冻融的过程),所以运输过程中绝对避免干冰运输。

      (5)关于叠氮化钠(sodium azide)的使用:

      为了防止微生物污染,叠氮化钠经常被加入到抗体中(终浓度0.02% (w/v))。ProSci的绝大部分抗体已经含有了0.02%-0.05%的叠氮化钠,在说明书的储存缓冲液中有标明。

      注:叠氮化钠的去除方式

      可以通过凝胶电泳或过滤的方式去除,IgG的分子量是150kDa(IgM约600kDa);叠氮化钠的分子量只有65Da,使用截留分子量为14kDa的滤膜即可将叠氮化钠从抗体中去除。

      3. 抗体保存条件解说

      (1) 保存温度和条件

      对于我们的很多抗体而言,分装成小等份并冻存于 -20℃ 或 -80℃ 是最佳保存条件。分装成小等份可最大程度减少由冻融造成的损伤,以及从单个试剂瓶中多次吸取而引入的污染。小等份只需冻融一次,如有剩余,可将剩余物保存于 4℃ 。 在收到抗体时,在 10,000 × g 下离心 20 秒以沉积截留于试剂瓶螺纹的溶液,并以小等份转移至低蛋白结合微量离心管中。小等份的量取决于实验人员在实验中通常采用的量。小等份应不小于10 μl;等份越小,储液浓度因抗体蒸发及吸附于保存瓶表面而受到的影响越大。

      在大多数情况下,收到抗体时在 4℃下保存一至两周,然后再冷冻进行长期保存是可接受的,但也许腹水液是例外,它可能包含蛋白酶,因而应该尽快冻存。同样,遵照数据表上的建议是重要的。

      (2) 免责条款和其它特别条件

      酶偶联抗体不应冻存,而应保存于 4℃. 冻融不仅影响抗体结合能力,还会降低酶活性。

      无论偶联至荧光染料、酶还是生物素,偶联抗体都应保存于深色试剂瓶中或用金属箔包裹。暴露于光线中将损害偶联物的活性。特别是荧光偶联物易受到光漂白影响,在实验的所有阶段都应避光。

      IgG3 同型抗体具有解冻时形成聚集物的独特趋势,应始终保存于 4℃。

      (3) 用叠氮化钠防止污染

      为了防止微生物污染,可将叠氮化钠加入抗体制备品中达到0.02% (w/v). 的终浓度。很多 Abcam 抗体已经包含这种防腐剂抗体已经包含这种防腐剂,所用浓度范围为 0.02 至 0.05%。这会标示在数据表上标题为“保存缓冲液”的栏目。

      (4) 不使用叠氮化钠的情形

      如果用抗体染色或处理活细胞,或如果用抗体进行体内研究,一定要使用不包含叠氮化钠的制备品。该抗菌剂也对大多数其它生物具有毒性:它阻断细胞色素电子传递系统。

      叠氮化钠会干扰氨基参与的任何偶联,应在偶联进行前除去。偶联后,抗体可保存于叠氮化钠中,除此以外,0.01% 硫汞撒(硫柳汞)不含伯胺,也是可接受的替代物。

      叠氮化钠可通过透析或凝胶过滤从抗体溶液中除去。IgG 的分子量为 150,000 道尔顿(IgM 为约 600,000);叠氮化钠的分子量为 65 道尔顿。截留分子量为 14,000 道尔顿的微透析装置可保留抗体同时使叠氮化物向外扩散。在保持于 4℃ 的磁性搅拌器上的烧杯中,每毫升抗体使用至少一升冷 PBS 并搅拌透析装置 6 小时。更换 PBS 两次,每次更换搅拌至少 6 小时。如有可能,所有材料都应灭菌并且所得的制备物应无菌操作。

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